OTAR3088/Variant_AllLabel_Large · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 1 2.94k	tags listlengths 1 2.94k
[ "TagSNP", "identification", "for", " ", "IL6R", " ", "was", "performed", "using", "the", "Tagger", "method", "implemented", "in", "Haploview", "software", "(", "v", "4.2", ";" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "Broad", "Institute", "of", "MIT/Harvard", "University", ",", "Cambridge", ",", "Massachussetts", ",", "USA", ")", "\n", "For", "this", "objective", ",", "the", "genotype", "data", "from", " ", "IL6R", " ", "transcribed", "region", "(", "154,377,669", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "a", "total", "of", "four", "splice", "donor/acceptor", "variants", ",", "three", "stop", "gaining", "variants", ",", "three", "frameshift", "variants", ",", "and", "87", "missense", "variants", "have", "been", "identified", "in", "the", " ", "IL6R", " ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "with", "a", "relatively", "high", "linkage", "disequilibrium", "(", "LD", ")", "between", "them", "(", "r", "2", " ", ">", "0.7", ")", "\n", "Pairwise", "tagging", "SNPs", "were", "selected", "(", "minor", "allele", "frequency", ">", "0.05", ",", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "Additional", "file", " ", "1", ")", "\n", "TagSNPs", "tagging", "<", "2", "SNPs", "were", "not", "selected", "\n", "A", "total", "of", "five", "tagSNPs", "were", "finally", "selected", "that", "tagged", "101", "SNPs", "identified", "in", "the", " "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "the", "3′", "block", "covers", "an", "~6", "kb", "IL6R", "sequence", "(", "154,432,877", "-", "154,439,865", "bp", ")", "\n", "Using", "Haploview", "software", "(", "v", "4.2", ";" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "Broad", "Institute", "of", "MIT/Harvard", "University", ",", "Cambridge", ",", "Massachussetts", ",", "USA", ")", ",", "we", "searched", "for", "tagging", "SNPs", "within", "each", "haplotype", "block", "\n ", "b", " ", "LD", "pattern", "associated", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "(", "see", "legend", ")", "\n", "Markers", "with", "high", "LD", "(", "i.e", "\n ", "r", "\n ", "2", " ", ">", "0.8", ")", "are", "mapped", "within", "the", "transcribed", "region", "of", "IL6R" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Genomic", "DNA", "was", "isolated", "from", "venous", "blood", "samples", "obtained", "from", "RA", "patients", "using", "the", "Chemagic", "Magnetic", "Separation", "Module", "I", "(", "PerkinElmer", ",", "Waltham", ",", "Massachusetts", ",", "USA", ")", "\n...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "A", "total", "of", "527", "RA", "patients", "were", "analyzed", "for", "association", "between", " ", "IL6R", " ", "tag", "SNPs", "and", "joint", "destruction", "\n", "We", "found", "a", "highly", "significant", "association", "between", "SNP", "rs4845618", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Table", " ", "1", ")", "\n", "After", "multiple", "test", "correction", "this", "SNP", "was", "almost", "significant", "(", "P", "FDR", " ", "=", "0.050", ")", "\n", "Both", "associated", " ", "IL6R", " ", "SNPs", "were", "in", "low", "LD", "b...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "154,414,086", "\n ", "G", "\n ", "0.40", "0.25", "(", "-0.51", "to", "1.01", ")", "0.51", "-", "-", "-", "rs4845374", "154,426,947", "\n ", "A", "\n ", "0.17", "1.14", "(", "0.18", "-", "2.10", ")", "0.02", "0.95", "(", "0.04", "-", "1.85", ")", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "indicating", "the", "fold", "difference", "in", "joint", "damage", "in", "the", "presence", "of", "the", "minor", "allele", "(", "i.e.", ",", "negative", "coefficients", "indicate", "a", "decrease", "in", "joint", "damage", ",", "positive", "coefficients...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "recessive", ")", "did", "not", "find", "strong", "evidence", "for", "an", "alternative", "genotype", "to", "phenotype", "association", "for", " ", "IL6R", " ", "SNPs", "(", "Table", "S1", "in", "Additional", "file", " ", "1", ")", "\n", "Onl...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "stratifying", "according", "to", "ACPA", "or", "RF", "status", "did", "not", "increase", "the", "statistical", "significance", "of", "IL6R", "SNPs", "with", "this", "disease", "severity", "trait", "\n", "Haplotype", "analysis", "using", "the", "two", "as...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Table", " ", "2", ")", "\n", "Both", "haplotypes", "were", "significantly", "associated", "with", "joint", "damage", "after", "multiple", "test", "correction", "(", "P", "FDR", " ", "=", "0.011", "and", " ", "P", "FDR", " ", "=", "0.015", "for", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Table", " ", "2", ")", "\n", "According", "to", "these", "results", "only", "," ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "the", "significant", "SNPs", "rs4845618", "and", "rs4845374", "were", "tested", "in", "the", "independent", "patient", "dataset", "\n", "Table", "2", "Haplotype", "association", "results", "between", " ", "IL6R", " ", "locus", "SNPs", "with", "the", "sev...	[ "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "\|rs4379670", "0.14", "-", "\n ", "TAACA", "\n ", "rs4845618\|rs4453032\|rs4845374\|rs6698040\|rs4379670", "0.02", "-", "\n ", "TGTCA", "\n ", "rs4845618\|rs4453032\|rs4845374\|rs6698040\|rs4379670", "0.27", "-", "\n ", "GATCA", "\n ", "rs4845618\|rs4453032\|rs4845374\|rs6698040\|rs4379670",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Center", "for", "Human", "Genetic", "Research", "(", "CHGR", ")", ",", "Massachusetts", "General", "Hospital", "(", "MGH", ")", ",", "and", "the", "Broad", "Institute", "of", "Harvard", "and", "MIT", ",", "Boston", ",", "Massachusetts", ")", "\n ", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "In", "the", "replication", "phase", "a", "total", "of", "705", "RA", "patients", "were", "analyzed", "for", "validation", "of", "the", "association", "between", " ", "IL6R", " ", "SNPs", "and", "the", "S-score", "\n", "We", "significantly", "validated", "th...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "positive/negative", "β", "coefficient", ")", "was", "the", "same", "as", "in", "the", "discovery", "cohort", "\n", "Both", "polymorphisms", "were", "significantly", "associated", "with", "joint", "damage", "after", "multiple", "test", "correction", "(", "P...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "...
[ " ", "Table", " ", "2", ")", "\n", "In", "this", "case", ",", "only", " ", "GT", " ", "haplotype", "association", "withstood", "multiple", "test", "correction", "(", "P", "FDR", " ", "=", "0.017", "and", " ", "P", "FDR", " ", "=", "0.078", "for", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "respectively", ")", "(", "Table", " ", "1", ")", "\n", "The", "association", "was", "strongest", "when", "considering", "the", "two", "SNPs", "as", "a", "haplotype", "(", "GT", " ", "haplotype", ",", " ", "P", " ", "=", "0.0058", ",", "meta-anal...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "key", "measure", "of", "severity", "in", "RA", "is", "the", "presence", "of", "joint", "erosion", "as", "determined", "by", "radiological", "examination", "\n", "The", "IL-6", "signaling", "pathway", "is", "essential", "in", "the", "proinflammatory", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "the", "IL-6", "receptor", "has", "proven", "highly", "efficacious", "in", "the", "inhibition", "of", "joint", "damage", "[", "5", "]", "\n", "We", "have", "performed", "a", "candidate-gene", "association", "study", "to", "test", "the", "association", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "P", " ", "=", "0.00011", ")", ",", "and", "a", "moderate", "association", "of", "a", "SNP", "in", "the", "sixth", "intron", "of", "isoforms", "1", "and", "2", "(", "rs4845374", ",", " ", "P", " ", "=", "0.0021", ")", "\n", "After", "combinin...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "...
[ " ", "and", "instead", "they", "are", "proxies", "for", "another", "polymorphism", "\n", "The", "LD", "pattern", "associated", "with", "the", "most", "strongly", "associated", "SNP", ",", "rs4845618", ",", "suggests", "that", "the", "causal", "polymorphism", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "the", "LD", "between", "rs4845374", "and", "the", "SNP", "associated", "with", "joint", "damage", "rs4845618", "is", "moderate", "in", "the", "Caucasian", "European", "population", ",", "like", "our", "Spanish", "RA", "patient", "cohorts", "(", "r", "2...	[ "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Table", " ", "1", ")", "\n", "These", "results", "therefore", "suggest", "that", "the", "genetic", "variant", "associated", "with", "joint", "erosions", "in", "RA", "is", "not", "the", "same", "variant", "associated", "with", "disease", "risk", "\n", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "therefore", "the", "functional", "link", "is", "generally", "difficult", "to", "identify", "\n", "In", "the", "present", "study", ",", "the", "SNP", "showing", "the", "strongest", "association", "to", "joint", "damage", ",", "rs4845618", ",", "i...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "data", "not", "shown", ")", "\n", "Also", ",", "analyzing", "the", "most", "recent", "regulatory", "and", "epigenetic", "evidence", "generated", "from", "large", "international", "consortia", "such", "as", "the", "Roadmap", "Epigenomics", "project", "[", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "including", "CD4", "+", " ", "T", "cells", "\n", "Together", "these", "results", "support", "the", "present", "genetic", "association", "with", "joint", "damage", "being", "likely", "to", "influence", " ", "IL6R", " ", "regulatory", "activity", "\n", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "there", "is", "increasing", "evidence", "that", "IL6R", "blockade", "prevents", "structural", "joint", "damage", "[", "19", "]", "\n", "IL-6", "is", "a", "pleiotropic", "inflammatory", "cytokine", "and", "therefore", "many", "biological", "mechanisms", "ca...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "the", "inhibition", "of", "inflammatory", "osteoclastogenesis", "after", "IL6R", "blocking", "[", "20", "]", "is", "clearly", "the", "most", "direct", "biological", "process", "influencing", "the", "level", "of", "joint", "destruction", "in", "RA", "\n", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "they", "provide", "additional", "support", "for", "the", "importance", "of", "variation", "at", "this", "gene", "with", "disease", "proinflammatory", "activity", "\n", "Future", "studies", "analyzing", "the", "association", "between", "SNPs", "in", "the", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "IL6R", " ", "SNP", "rs8192284", "(", "now", "merged", "into", "SNP", "rs2228145", ")", "-", "which", "had", "been", "previously", "associated", "with", "disease", "activity", "in", "RA", "[", "22", "]", "-", "was", "not", "selected", "for", "genot...	[ "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "therefore", "supports", "the", "lack", "of", "association", "of", "this", "variant", "with", "joint", "damage", "in", "RA", "\n", "This", "result", "confirms", "that", "the", "objective", "selection", "of", "the", "most", "informative", "markers", "is", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "joint", "damage", "in", "the", "RA", "cohorts", ",", "and", "therefore", "found", "a", "more", "significant", "association", "with", "the", "genetic", "variation", "at", "the", " ", "IL6R", " ", "locus", "\n", "Nonetheless", ",", "the", "significant", "asso...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "this", "simplified", "erosion", "score", "could", "be", "a", "practical", "tool", "in", "those", "instances", "like", "genetic", "studies", "in", "which", "a", "large", "number", "of", "patient", "data", "must", "be", "collected", "from", "multiple", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "auxological", "profiles", ",", "hormone", "results", ",", "and", "additional", "clinical", "features", "of", "the", "patients", "are", "listed", "in", "Table", " ", "1", "\n", "The", "mean", "height", "SDS", "of", "17", "genetically", "diagnosed", "p...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "respectively", "\n", "A", "GHD", "was", "identified", "in", "23.5", "%", "(", "4/17", ")", "of", "patients", "who", "underwent", "a", "GH", "provocation", "test", "\n", "Two", "of", "the", "17", "(", "11.7", "%", ")", "patients", "were", "small",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "low-set", "ears", "\n", "Developmental", "delay", "(", "DD", ")", "or", "intellectual", "disability", "(", "ID", ")", "was", "noted", "in", "12", "of", "17", "patients", "\n", "Other", "accompanying", "anomalies", "included", "skeletal", "anomal...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "ng/mL", "(", "SDS", ")", "IGF", "BP3", ",", "ng/mL", "(", "SDS", ")", "Notes", "1", "K1", "3.6", "M", "90.6", "(", "-", " ", "2.07", ")", "12.6", "(", "-", " ", "1.90", ")", "51.0", "(", "0.59", ")", "174.5", "40", " ", "+", " ", "0",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "GHD", "2", "K2", "15.0", "F", "143.2", "(", "-", " ", "3.06", ")", "48.6", "(", "-", " ", "0.43", ")", "49.8", "(", "-", " ", "3.90", ")", "149.5", "38", " ", "+", " ", "0", "2.9", "(", "-", " ", "0.32", ")", "A", "545.1", "(", "1.9...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "speech", "delay", ",", "GHD", ",", "autistic", "spectrum", "disorder", ",", "and", "DD", "4", "K4", "5.9", "M", "104.8", "(", "-", " ", "3.43", ")", "14.4", "(", "-", " ", "4.91", ")", "49.0", "(", "-", " ", "1.83", ")", "172.0", "39", " ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "ID", "5", "K5", "12.0", "M", "133.5", "(", "-", " ", "2.09", ")", "36.7", "(", "-", " ", "0.70", ")", "N/A", "166.5", "40", " ", "+", " ", "0", "2.8", "(", "-", " ", "1.73", ")", "D", "66.6", "(", "-", " ", "3.09", ")", "514"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "GHD", "K6B", "10.9", "M", "128.5", "(", "-", " ", "2.04", ")", "30", "(", "-", " ", "1.05", ")", "NA", "28", " ", "+", " ", "3", "1.1", "(", "0.10", ")", "D", "176.4", "(", "-", " ", "0.16", ")", "2980", "(", "-", " ", "0.08"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "ID", "8", "K8", "1.6", "M", "71", "(", "-", " ", "3.59", ")", "7.6", "(", "-", " ", "3.71", ")", "43.0", "(", "-", " ", "3.73", ")", "170.5", "39", " ", "+", " ", "0", "2.6", "(", "-", " ", "1.74", ")", "D", "41.3", "(", "-", " ",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "short", "arms", "and", "legs", ",", "and", "brachydactyly", "10", "K10", "1.0", "M", "63.4", "(", "-", " ", "4.27", ")", "6.7", "(", "-", " ", "3.31", ")", "41.0", "(", "-", " ", "4.26", ")", "N/A", "26", " ", "+", " ", "2", "0.9", "(",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "epilepsy", ",", "and", "ID", "12", "K12", "2.5", "F", "81.7", "(", "-", " ", "2.30", ")", "11.9", "(", "-", " ", "0.85", ")", "43.5", "(", "-", " ", "3.00", ")", "NA", "39", " ", "+", " ", "1", "2.7", "(", "-", " ", "1.19", ")", "D"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "DD", "14", "K14", "3", "M", "85.4", "(", "-", " ", "2.80", ")", "12.4", "(", "-", " ", "1.40", ")", "45", "(", "-", " ", "2.60", ")", "NA", "42", " ", "+", " ", "0", "3.4", "(", "-", " ", "1.26", ")", "N", "87.13", "(", "-"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "hearing", "defect", ",", "and", "DD", "16", "K16", "9.2", "F", "100", "(", "-", " ", "6.10", ")", "15", "(", "-", " ", "6.24", ")", "NA", "33", " ", "+", " ", "3", "2.2", "(", "0.76", ")", "D", "34.06", "(", "-", " ", "2.25", ")", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Fm", " ", "family", ",", " ", "GA", " ", "gestational", "age", ",", " ", "GHD", " ", "growth", "hormone", "deficiency", ",", " ", "HC", " ", "head", "circumference", ",", " ", "Ht", " ", "height", ",", " ", "HTN", " ", "hypertension", ",", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Wt", " ", "weight", "The", "previous", "clinical", "assessments", "and", "final", "diagnosis", "for", "each", "patient", "are", "shown", "in", "Table", " ", "2", "\n", "For", "5", "of", "17", "patients", "(", "K3", ",", "K5", ",", "K7", ",", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "Hajdu-Cheney", "syndrome", "(", "HCS", ")", "(", "K15", ")", "by", "TES", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "\n ", "Table", "2", "Genetic", "results", "for", "patients", "with", "short", "stature", "Family", "Previous", "clinical", "assessment", "Previous", "conventional", "analysis", "Final", "diagnosis", "Gene", "Nucleotide/AA", "change", "Inheritance", "mode", "In", "s...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Arg193Gln", "De", "novo", "LPV", "PV", "No", "[", "45", "]", "2", "TS", "46,XX", "Hajdu-Cheney", "syndrome", "NOTCH2", "c.2816C", ">", "T" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar" ]
[ "/p", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "Pro939Leu", "De", "novo", "Deleterious", "(", "0.013", ")", "Benign", "(", "0.008", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "VUS", "Yes", "3", "USGD", "46,XY", "CMA", "Cerebral", "creatine", "deficiency", "syndrome", "SLC6A8", "c.942_944del/p", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Phe315del", "Het", ",", "mat", "LPV", "PV", "No", "[", "46", "]", "4", "NS", "PTPN11", "SOS1", ",", " ", "KRAS", ",", " ", "and", " ", "NRAS", "Coffin-Lowry", "syndrome", "RPS6KA3", "c.1606G", ">", "T/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Val536Phe", "Het", ",", "mat", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Probably", "damaging", "(", "1.00", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "LPV", "PV", "Yes", "5", "USGD", "46,XY", "Acid-labile", "subunit", "deficiency", "IGFALS", "c.1346T", ">", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Leu449Arg", "Com", "het", ",", "pat", "," ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "mat", "Tolerated", "(", "0.06", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.997", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "c.1783C", ">", "T/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Arg595Trp", ")", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Probably", "damaging", "(", "1.000", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "6A", "GHS", "46,XY", ",", "CMA", "Sheldon-Hall", "syndrome", "TNNT3", "c.47_49del/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glu18del", "Het", ",", "pat", "VUS", "VUS", "Yes", "7", "USGD", "46,XY", ",", "CMA", "Meckel", "syndrome", "(", "Type", "7", ")", "NPHP3", "c.73G", ">", "T/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Gly25Cys", "Het", ",", "pat", "Het", "," ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "mat", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Benign", "(", "0.001", ")", "(", "1.00", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "c.489T", ">", "G/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "His163Gln", "Tolerated", "(", "0.19", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.723", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "8", "CdLS", "NIPBL", "Coffin-Siris", "syndrome", "ARID1B", "c.5547delC/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Leu1850", "*", "De", "novo", "PV", "PV", "Yes", "9", "Achondroplasia", "FGFR3", "AMDM", "NPR2", "c.2326C", ">", "T/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Arg776Trp", "Het", ",", "pat", "PV", "PV", "No", "[", "29", ",", " ", "47", "]", "10", "NS", "PTPN11", "SOS1", ",", " ", "KRAS", ",", " ", "and", " ", "NRAS", "MR", ",", "AD", "type51", "KMT5B", "c.2422_2425del/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Leu808Trpfs*50", "De", "novo", "PV", "PV", "Yes", "11", "USGD", "46,XX", ",", "CMA", "MR", ",", "AR", "type3", "CC2D1A", "c.1610C", ">", "T" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar" ]
[ "/p", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "Ser537Leu", "Homo", "Deleterious", "(", "0.03", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.997", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "12", "CdLS", "NIPBL", "CdLS", "type3", "SMC3", "c.1453_1455delGCT/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ala485del", "De", "novo", "LPV", "PV", "Yes", "13", "CATCH22", "CMA", "MEIS2-related", "syndrome", "MEIS2", "c.998_1000del/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Arg333del", "De", "novo", "PV", "PV", "No", "[", "48", "]", "14", "Skeletal", "dysplasia", "ND", "MOPD2", "PCNT", "c.3716G", ">", "A/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Arg1239His", "Compound", "hetero", "Tolerated", "(", "0.28", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.856", ")", "Tolerated", "(", "0.00", ")", "VUS", "LPV", "No", "[", "49", "]", "c.7459C", ">", "G/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Leu2487Val", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.997", ")" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tolerated", "(", "0.00", ")", "VUS", "LPV", "No", "[", "50", "]", "15", "USGD", "46,XY", "MLPA", "Hajdu-Cheney", "syndrome", "NOTCH2", "c.5471G", ">", "A/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Arg1824His", "De", "novo", "Deleterious", "(", "0.001", ")", "Benign", "(", "0.008", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "VUS", "Yes", "16", "CATCH22", "CMA", "MED13L", "syndrome", "MED13L", "c.5444C", ">", "T/p", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Thr1815Met", "Het", ",", "mat", "Tolerated", "(", "0.17", ")", "Probably", "damaging", "(", "1.000", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "AA", " ", "amino", "acid", ",", " ", "AD", " ", "autosomal", "dominant", ",", " ", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "CMA", " ", "chromosomal", "microarray", ",", " ", "GHS", " ", "Goldenhar", "syndrome", ",", " ", "hemi", " ", "hemizygote", ",", " ", "het", " ", "heterozygote", ",", " ", "LPV", " ", "likely", "pathogenic", "variant", ",", " ", "mat", " ", "mat...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "VUS", " ", "variant", "of", "uncertain", "significance", "Three", "(", "17.6", "%", ")", "patients", "(", "K1", ",", "K4", ",", "and", "K10", ")", "had", "suspected", "syndromes", ",", "such", "as", "Noonan", "syndrome", ",", "based", "on", "fac...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "GHD", "\n", "The", "patient", "was", "confirmed", "to", "have", "cleidocranial", "dysplasia", "with", "a", "de", "novo", "missense", "mutation", ",", "c.578G", ">", "A", "(", "p.", "R193Q", ")", ",", "in", " ", "RUNX2", "\n", "Patient", "K...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ " ", "in", " ", "RPS6KA3", " ", "was", "identified", "in", "a", "patient", "with", "Coffin-Lowry", "syndrome", "\n", "Patient", "K10", "displayed", "severe", "SS", "(", "-", " ", "4.27", "SDS", ")", "\n", "He", "showed", "dysmorphic", "facial", "features",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "autosomal", "dominant", "type", "51", "\n", "Patient", "K2", "was", "initially", "suspected", "of", "having", "Turner", "syndrome", "with", "a", "severe", "SS", "(", "-", " ", "3.06", "SDS", ")", ",", "dysmorphic", "facial", "features", ",", "such", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "she", "was", "diagnosed", "with", "HCS", "caused", "by", "a", "de", "novo", "missense", "variant", ",", "c.2816C", ">", "T", "(", "p.", "P939L", ")", "in", "the", " ", "NOTCH2", " ", "gene", "(", "Fig.", " ", "2", "g", ")", "\n", "Fig", "\...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ " ", "c", " ", "hypertelorism", ",", "epicanthal", "fold", ",", "broad", "nose", ",", "anteverted", "nares", ",", "short", "philtrum", ",", "large", "mouth", ",", "thick/everted", "lips", ",", "and", "large", "ears", ",", "in", "patient", "K4", "with", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "f", " ", "relative", "macrocephaly", "with", "frontal", "bossing", ",", "short", "arms", "and", "legs", ",", "and", "brachydactyly", "in", "patient", "K9", "with", "acromesomelic", "dysplasia", "Maroteaux-type", ";", " ", "g", " ", "small", "chin", ",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "j", " ", "hypotonic", "fish-mouth", "appearance", ",", "hypertelorism", ",", "and", "flat", "nasal", "bridge", "with", "bulbous", "nasal", "tip", "in", "patient", "K16", "with", "MED13L", "syndrome", ";", " ", "k", ",", " ", "l", " ", "her", "(", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "d", " ", "wormian", "bones", "are", "marked", "by", "yellow", "arrows", "in", "the", "lambdoidal", "suture", ";", " ", "e", " ", "lumbar", "scoliosis", "is", "marked", "by", "yellow", "arrows", ";" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "f", " ", "malocclusion", "and", "biconcave", "vertebra", "bodies", "marked", "by", "yellow", "arrows", "\n", "Two", "novel", "heterozygous", "variants", "in", "the", " ", "NOTCH2", " ", "gene", "(", "NM_024408.3", ")", "\n ", "g", ",", " ", "h", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", ...
[ " ", "shown", "in", "the", "dark", "square", "box", "\n", "Sequences", "were", "aligned", "using", "blastp", "[", "https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/", "]", ";" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "i", ",", " ", "j", " ", "wild-type", "and", "mutant", "residues", "(", "p.", "P939L", "and", "p.", "R1824H", ")", "in", "the", "NOTCH2", "protein", "are", "shown", "in", "light-green", "and", "are", "also", "represented", "as", "sticks", "alongsid...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "indicating", "any", "type", "of", "interaction", "\n", "Purple", "dots", "represent", "metal", "complex", "interactions", "with", "a", "surrounding", "residue", "\n", "Orange", "dots", "represent", "weak", "hydrogen", "bonds", "with", "a", "surrounding", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "manifestations", ",", "such", "as", "asymmetric", "face", ",", "right", "cryptotia", ",", "nasolabial", "fold", ",", "and", "small", "mouth", "with", "a", "high", "arched", "roof", "of", "the", "mouth", "(", "Fig.", " ", "1", "d", ")", "\n", "He", "d...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "in", " ", "TNNT3", " ", "was", "identified", "in", "the", "proband", "and", "his", "family", "members", "and", "was", "responsible", "for", "Sheldon", "Hall", "syndrome", "(", "SHS", ")", "\n", "Two", "(", "11.7", "%", ")", "patients", "(", "K8",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "in", " ", "ARID1B", " ", "and", "patient", "K12", "harbored", "a", "de", "novo", "novel", "variant", ",", "c.1453_1455delGCT", "(", "p.", "A485del", ")", ",", "in", " ", "SMC3", ",", "which", "is", "related", "to", "a", "mild", "variant", "of", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "however", ",", "no", "mutation", "was", "found", "in", " ", "FGFR3", "\n", "Dysmorphic", "facial", "features", ",", "such", "as", "relatively", "macrocephaly", "with", "frontal", "bossing", "and", "micrognathia", ",", "were", "observed", "(", "Fig.", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "(", "p.", "A776W", ")", ",", "in", "the", "kinase", "homology", "domain", "of", "the", " ", "NPR2", " ", "gene", "was", "identified", "in", "the", "proband", "and", "her", "father", "(", "Fig.", " ", "3", "c", ")", "\n", "Fig", "\n", "3", ...	[ "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "TagSNP", "identification", "for", " ", "IL6R", " ", "was", "performed", "using", "the", "Tagger", "method", "implemented", "in", "Haploview", "software", "(", "v", "4.2", ";" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "Broad", "Institute", "of", "MIT/Harvard", "University", ",", "Cambridge", ",", "Massachussetts", ",", "USA", ")", "\n", "For", "this", "objective", ",", "the", "genotype", "data", "from", " ", "IL6R", " ", "transcribed", "region", "(", "154,377,669", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "a", "total", "of", "four", "splice", "donor/acceptor", "variants", ",", "three", "stop", "gaining", "variants", ",", "three", "frameshift", "variants", ",", "and", "87", "missense", "variants", "have", "been", "identified", "in", "the", " ", "IL6R", " ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "with", "a", "relatively", "high", "linkage", "disequilibrium", "(", "LD", ")", "between", "them", "(", "r", "2", " ", ">", "0.7", ")", "\n", "Pairwise", "tagging", "SNPs", "were", "selected", "(", "minor", "allele", "frequency", ">", "0.05", ",", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "Additional", "file", " ", "1", ")", "\n", "TagSNPs", "tagging", "<", "2", "SNPs", "were", "not", "selected", "\n", "A", "total", "of", "five", "tagSNPs", "were", "finally", "selected", "that", "tagged", "101", "SNPs", "identified", "in", "the", " "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "the", "3′", "block", "covers", "an", "~6", "kb", "IL6R", "sequence", "(", "154,432,877", "-", "154,439,865", "bp", ")", "\n", "Using", "Haploview", "software", "(", "v", "4.2", ";" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "Broad", "Institute", "of", "MIT/Harvard", "University", ",", "Cambridge", ",", "Massachussetts", ",", "USA", ")", ",", "we", "searched", "for", "tagging", "SNPs", "within", "each", "haplotype", "block", "\n ", "b", " ", "LD", "pattern", "associated", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "(", "see", "legend", ")", "\n", "Markers", "with", "high", "LD", "(", "i.e", "\n ", "r", "\n ", "2", " ", ">", "0.8", ")", "are", "mapped", "within", "the", "transcribed", "region", "of", "IL6R" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Genomic", "DNA", "was", "isolated", "from", "venous", "blood", "samples", "obtained", "from", "RA", "patients", "using", "the", "Chemagic", "Magnetic", "Separation", "Module", "I", "(", "PerkinElmer", ",", "Waltham", ",", "Massachusetts", ",", "USA", ")", "\n...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "A", "total", "of", "527", "RA", "patients", "were", "analyzed", "for", "association", "between", " ", "IL6R", " ", "tag", "SNPs", "and", "joint", "destruction", "\n", "We", "found", "a", "highly", "significant", "association", "between", "SNP", "rs4845618", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Table", " ", "1", ")", "\n", "After", "multiple", "test", "correction", "this", "SNP", "was", "almost", "significant", "(", "P", "FDR", " ", "=", "0.050", ")", "\n", "Both", "associated", " ", "IL6R", " ", "SNPs", "were", "in", "low", "LD", "b...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "154,414,086", "\n ", "G", "\n ", "0.40", "0.25", "(", "-0.51", "to", "1.01", ")", "0.51", "-", "-", "-", "rs4845374", "154,426,947", "\n ", "A", "\n ", "0.17", "1.14", "(", "0.18", "-", "2.10", ")", "0.02", "0.95", "(", "0.04", "-", "1.85", ")", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "indicating", "the", "fold", "difference", "in", "joint", "damage", "in", "the", "presence", "of", "the", "minor", "allele", "(", "i.e.", ",", "negative", "coefficients", "indicate", "a", "decrease", "in", "joint", "damage", ",", "positive", "coefficients...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "recessive", ")", "did", "not", "find", "strong", "evidence", "for", "an", "alternative", "genotype", "to", "phenotype", "association", "for", " ", "IL6R", " ", "SNPs", "(", "Table", "S1", "in", "Additional", "file", " ", "1", ")", "\n", "Onl...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "stratifying", "according", "to", "ACPA", "or", "RF", "status", "did", "not", "increase", "the", "statistical", "significance", "of", "IL6R", "SNPs", "with", "this", "disease", "severity", "trait", "\n", "Haplotype", "analysis", "using", "the", "two", "as...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Table", " ", "2", ")", "\n", "Both", "haplotypes", "were", "significantly", "associated", "with", "joint", "damage", "after", "multiple", "test", "correction", "(", "P", "FDR", " ", "=", "0.011", "and", " ", "P", "FDR", " ", "=", "0.015", "for", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Table", " ", "2", ")", "\n", "According", "to", "these", "results", "only", "," ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "the", "significant", "SNPs", "rs4845618", "and", "rs4845374", "were", "tested", "in", "the", "independent", "patient", "dataset", "\n", "Table", "2", "Haplotype", "association", "results", "between", " ", "IL6R", " ", "locus", "SNPs", "with", "the", "sev...

[ "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "|rs4379670", "0.14", "-", "\n ", "TAACA", "\n ", "rs4845618|rs4453032|rs4845374|rs6698040|rs4379670", "0.02", "-", "\n ", "TGTCA", "\n ", "rs4845618|rs4453032|rs4845374|rs6698040|rs4379670", "0.27", "-", "\n ", "GATCA", "\n ", "rs4845618|rs4453032|rs4845374|rs6698040|rs4379670",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Center", "for", "Human", "Genetic", "Research", "(", "CHGR", ")", ",", "Massachusetts", "General", "Hospital", "(", "MGH", ")", ",", "and", "the", "Broad", "Institute", "of", "Harvard", "and", "MIT", ",", "Boston", ",", "Massachusetts", ")", "\n ", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "In", "the", "replication", "phase", "a", "total", "of", "705", "RA", "patients", "were", "analyzed", "for", "validation", "of", "the", "association", "between", " ", "IL6R", " ", "SNPs", "and", "the", "S-score", "\n", "We", "significantly", "validated", "th...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "positive/negative", "β", "coefficient", ")", "was", "the", "same", "as", "in", "the", "discovery", "cohort", "\n", "Both", "polymorphisms", "were", "significantly", "associated", "with", "joint", "damage", "after", "multiple", "test", "correction", "(", "P...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "...

[ " ", "Table", " ", "2", ")", "\n", "In", "this", "case", ",", "only", " ", "GT", " ", "haplotype", "association", "withstood", "multiple", "test", "correction", "(", "P", "FDR", " ", "=", "0.017", "and", " ", "P", "FDR", " ", "=", "0.078", "for", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "respectively", ")", "(", "Table", " ", "1", ")", "\n", "The", "association", "was", "strongest", "when", "considering", "the", "two", "SNPs", "as", "a", "haplotype", "(", "GT", " ", "haplotype", ",", " ", "P", " ", "=", "0.0058", ",", "meta-anal...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "key", "measure", "of", "severity", "in", "RA", "is", "the", "presence", "of", "joint", "erosion", "as", "determined", "by", "radiological", "examination", "\n", "The", "IL-6", "signaling", "pathway", "is", "essential", "in", "the", "proinflammatory", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "the", "IL-6", "receptor", "has", "proven", "highly", "efficacious", "in", "the", "inhibition", "of", "joint", "damage", "[", "5", "]", "\n", "We", "have", "performed", "a", "candidate-gene", "association", "study", "to", "test", "the", "association", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "P", " ", "=", "0.00011", ")", ",", "and", "a", "moderate", "association", "of", "a", "SNP", "in", "the", "sixth", "intron", "of", "isoforms", "1", "and", "2", "(", "rs4845374", ",", " ", "P", " ", "=", "0.0021", ")", "\n", "After", "combinin...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "...

[ " ", "and", "instead", "they", "are", "proxies", "for", "another", "polymorphism", "\n", "The", "LD", "pattern", "associated", "with", "the", "most", "strongly", "associated", "SNP", ",", "rs4845618", ",", "suggests", "that", "the", "causal", "polymorphism", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "the", "LD", "between", "rs4845374", "and", "the", "SNP", "associated", "with", "joint", "damage", "rs4845618", "is", "moderate", "in", "the", "Caucasian", "European", "population", ",", "like", "our", "Spanish", "RA", "patient", "cohorts", "(", "r", "2...

[ "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Table", " ", "1", ")", "\n", "These", "results", "therefore", "suggest", "that", "the", "genetic", "variant", "associated", "with", "joint", "erosions", "in", "RA", "is", "not", "the", "same", "variant", "associated", "with", "disease", "risk", "\n", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "therefore", "the", "functional", "link", "is", "generally", "difficult", "to", "identify", "\n", "In", "the", "present", "study", ",", "the", "SNP", "showing", "the", "strongest", "association", "to", "joint", "damage", ",", "rs4845618", ",", "i...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "data", "not", "shown", ")", "\n", "Also", ",", "analyzing", "the", "most", "recent", "regulatory", "and", "epigenetic", "evidence", "generated", "from", "large", "international", "consortia", "such", "as", "the", "Roadmap", "Epigenomics", "project", "[", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "including", "CD4", "+", " ", "T", "cells", "\n", "Together", "these", "results", "support", "the", "present", "genetic", "association", "with", "joint", "damage", "being", "likely", "to", "influence", " ", "IL6R", " ", "regulatory", "activity", "\n", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "there", "is", "increasing", "evidence", "that", "IL6R", "blockade", "prevents", "structural", "joint", "damage", "[", "19", "]", "\n", "IL-6", "is", "a", "pleiotropic", "inflammatory", "cytokine", "and", "therefore", "many", "biological", "mechanisms", "ca...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "the", "inhibition", "of", "inflammatory", "osteoclastogenesis", "after", "IL6R", "blocking", "[", "20", "]", "is", "clearly", "the", "most", "direct", "biological", "process", "influencing", "the", "level", "of", "joint", "destruction", "in", "RA", "\n", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "they", "provide", "additional", "support", "for", "the", "importance", "of", "variation", "at", "this", "gene", "with", "disease", "proinflammatory", "activity", "\n", "Future", "studies", "analyzing", "the", "association", "between", "SNPs", "in", "the", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "IL6R", " ", "SNP", "rs8192284", "(", "now", "merged", "into", "SNP", "rs2228145", ")", "-", "which", "had", "been", "previously", "associated", "with", "disease", "activity", "in", "RA", "[", "22", "]", "-", "was", "not", "selected", "for", "genot...

[ "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "therefore", "supports", "the", "lack", "of", "association", "of", "this", "variant", "with", "joint", "damage", "in", "RA", "\n", "This", "result", "confirms", "that", "the", "objective", "selection", "of", "the", "most", "informative", "markers", "is", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "joint", "damage", "in", "the", "RA", "cohorts", ",", "and", "therefore", "found", "a", "more", "significant", "association", "with", "the", "genetic", "variation", "at", "the", " ", "IL6R", " ", "locus", "\n", "Nonetheless", ",", "the", "significant", "asso...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "this", "simplified", "erosion", "score", "could", "be", "a", "practical", "tool", "in", "those", "instances", "like", "genetic", "studies", "in", "which", "a", "large", "number", "of", "patient", "data", "must", "be", "collected", "from", "multiple", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "auxological", "profiles", ",", "hormone", "results", ",", "and", "additional", "clinical", "features", "of", "the", "patients", "are", "listed", "in", "Table", " ", "1", "\n", "The", "mean", "height", "SDS", "of", "17", "genetically", "diagnosed", "p...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "respectively", "\n", "A", "GHD", "was", "identified", "in", "23.5", "%", "(", "4/17", ")", "of", "patients", "who", "underwent", "a", "GH", "provocation", "test", "\n", "Two", "of", "the", "17", "(", "11.7", "%", ")", "patients", "were", "small",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "low-set", "ears", "\n", "Developmental", "delay", "(", "DD", ")", "or", "intellectual", "disability", "(", "ID", ")", "was", "noted", "in", "12", "of", "17", "patients", "\n", "Other", "accompanying", "anomalies", "included", "skeletal", "anomal...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "ng/mL", "(", "SDS", ")", "IGF", "BP3", ",", "ng/mL", "(", "SDS", ")", "Notes", "1", "K1", "3.6", "M", "90.6", "(", "-", " ", "2.07", ")", "12.6", "(", "-", " ", "1.90", ")", "51.0", "(", "0.59", ")", "174.5", "40", " ", "+", " ", "0",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "GHD", "2", "K2", "15.0", "F", "143.2", "(", "-", " ", "3.06", ")", "48.6", "(", "-", " ", "0.43", ")", "49.8", "(", "-", " ", "3.90", ")", "149.5", "38", " ", "+", " ", "0", "2.9", "(", "-", " ", "0.32", ")", "A", "545.1", "(", "1.9...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "speech", "delay", ",", "GHD", ",", "autistic", "spectrum", "disorder", ",", "and", "DD", "4", "K4", "5.9", "M", "104.8", "(", "-", " ", "3.43", ")", "14.4", "(", "-", " ", "4.91", ")", "49.0", "(", "-", " ", "1.83", ")", "172.0", "39", " ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "ID", "5", "K5", "12.0", "M", "133.5", "(", "-", " ", "2.09", ")", "36.7", "(", "-", " ", "0.70", ")", "N/A", "166.5", "40", " ", "+", " ", "0", "2.8", "(", "-", " ", "1.73", ")", "D", "66.6", "(", "-", " ", "3.09", ")", "514"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "GHD", "K6B", "10.9", "M", "128.5", "(", "-", " ", "2.04", ")", "30", "(", "-", " ", "1.05", ")", "NA", "28", " ", "+", " ", "3", "1.1", "(", "0.10", ")", "D", "176.4", "(", "-", " ", "0.16", ")", "2980", "(", "-", " ", "0.08"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "ID", "8", "K8", "1.6", "M", "71", "(", "-", " ", "3.59", ")", "7.6", "(", "-", " ", "3.71", ")", "43.0", "(", "-", " ", "3.73", ")", "170.5", "39", " ", "+", " ", "0", "2.6", "(", "-", " ", "1.74", ")", "D", "41.3", "(", "-", " ",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "short", "arms", "and", "legs", ",", "and", "brachydactyly", "10", "K10", "1.0", "M", "63.4", "(", "-", " ", "4.27", ")", "6.7", "(", "-", " ", "3.31", ")", "41.0", "(", "-", " ", "4.26", ")", "N/A", "26", " ", "+", " ", "2", "0.9", "(",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "epilepsy", ",", "and", "ID", "12", "K12", "2.5", "F", "81.7", "(", "-", " ", "2.30", ")", "11.9", "(", "-", " ", "0.85", ")", "43.5", "(", "-", " ", "3.00", ")", "NA", "39", " ", "+", " ", "1", "2.7", "(", "-", " ", "1.19", ")", "D"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "DD", "14", "K14", "3", "M", "85.4", "(", "-", " ", "2.80", ")", "12.4", "(", "-", " ", "1.40", ")", "45", "(", "-", " ", "2.60", ")", "NA", "42", " ", "+", " ", "0", "3.4", "(", "-", " ", "1.26", ")", "N", "87.13", "(", "-"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "hearing", "defect", ",", "and", "DD", "16", "K16", "9.2", "F", "100", "(", "-", " ", "6.10", ")", "15", "(", "-", " ", "6.24", ")", "NA", "33", " ", "+", " ", "3", "2.2", "(", "0.76", ")", "D", "34.06", "(", "-", " ", "2.25", ")", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Fm", " ", "family", ",", " ", "GA", " ", "gestational", "age", ",", " ", "GHD", " ", "growth", "hormone", "deficiency", ",", " ", "HC", " ", "head", "circumference", ",", " ", "Ht", " ", "height", ",", " ", "HTN", " ", "hypertension", ",", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Wt", " ", "weight", "The", "previous", "clinical", "assessments", "and", "final", "diagnosis", "for", "each", "patient", "are", "shown", "in", "Table", " ", "2", "\n", "For", "5", "of", "17", "patients", "(", "K3", ",", "K5", ",", "K7", ",", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "Hajdu-Cheney", "syndrome", "(", "HCS", ")", "(", "K15", ")", "by", "TES", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "\n ", "Table", "2", "Genetic", "results", "for", "patients", "with", "short", "stature", "Family", "Previous", "clinical", "assessment", "Previous", "conventional", "analysis", "Final", "diagnosis", "Gene", "Nucleotide/AA", "change", "Inheritance", "mode", "In", "s...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Arg193Gln", "De", "novo", "LPV", "PV", "No", "[", "45", "]", "2", "TS", "46,XX", "Hajdu-Cheney", "syndrome", "NOTCH2", "c.2816C", ">", "T" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar" ]

[ "/p", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Pro939Leu", "De", "novo", "Deleterious", "(", "0.013", ")", "Benign", "(", "0.008", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "VUS", "Yes", "3", "USGD", "46,XY", "CMA", "Cerebral", "creatine", "deficiency", "syndrome", "SLC6A8", "c.942_944del/p", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Phe315del", "Het", ",", "mat", "LPV", "PV", "No", "[", "46", "]", "4", "NS", "PTPN11", "SOS1", ",", " ", "KRAS", ",", " ", "and", " ", "NRAS", "Coffin-Lowry", "syndrome", "RPS6KA3", "c.1606G", ">", "T/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Val536Phe", "Het", ",", "mat", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Probably", "damaging", "(", "1.00", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "LPV", "PV", "Yes", "5", "USGD", "46,XY", "Acid-labile", "subunit", "deficiency", "IGFALS", "c.1346T", ">", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Leu449Arg", "Com", "het", ",", "pat", "," ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "mat", "Tolerated", "(", "0.06", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.997", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "c.1783C", ">", "T/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Arg595Trp", ")", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Probably", "damaging", "(", "1.000", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "6A", "GHS", "46,XY", ",", "CMA", "Sheldon-Hall", "syndrome", "TNNT3", "c.47_49del/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glu18del", "Het", ",", "pat", "VUS", "VUS", "Yes", "7", "USGD", "46,XY", ",", "CMA", "Meckel", "syndrome", "(", "Type", "7", ")", "NPHP3", "c.73G", ">", "T/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Gly25Cys", "Het", ",", "pat", "Het", "," ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "mat", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Benign", "(", "0.001", ")", "(", "1.00", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "c.489T", ">", "G/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "His163Gln", "Tolerated", "(", "0.19", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.723", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "8", "CdLS", "NIPBL", "Coffin-Siris", "syndrome", "ARID1B", "c.5547delC/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Leu1850", "*", "De", "novo", "PV", "PV", "Yes", "9", "Achondroplasia", "FGFR3", "AMDM", "NPR2", "c.2326C", ">", "T/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Arg776Trp", "Het", ",", "pat", "PV", "PV", "No", "[", "29", ",", " ", "47", "]", "10", "NS", "PTPN11", "SOS1", ",", " ", "KRAS", ",", " ", "and", " ", "NRAS", "MR", ",", "AD", "type51", "KMT5B", "c.2422_2425del/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Leu808Trpfs*50", "De", "novo", "PV", "PV", "Yes", "11", "USGD", "46,XX", ",", "CMA", "MR", ",", "AR", "type3", "CC2D1A", "c.1610C", ">", "T" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar" ]

[ "/p", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Ser537Leu", "Homo", "Deleterious", "(", "0.03", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.997", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "12", "CdLS", "NIPBL", "CdLS", "type3", "SMC3", "c.1453_1455delGCT/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ala485del", "De", "novo", "LPV", "PV", "Yes", "13", "CATCH22", "CMA", "MEIS2-related", "syndrome", "MEIS2", "c.998_1000del/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Arg333del", "De", "novo", "PV", "PV", "No", "[", "48", "]", "14", "Skeletal", "dysplasia", "ND", "MOPD2", "PCNT", "c.3716G", ">", "A/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Arg1239His", "Compound", "hetero", "Tolerated", "(", "0.28", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.856", ")", "Tolerated", "(", "0.00", ")", "VUS", "LPV", "No", "[", "49", "]", "c.7459C", ">", "G/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Leu2487Val", "Deleterious", "(", "0.00", ")", "Probably", "damaging", "(", "0.997", ")" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tolerated", "(", "0.00", ")", "VUS", "LPV", "No", "[", "50", "]", "15", "USGD", "46,XY", "MLPA", "Hajdu-Cheney", "syndrome", "NOTCH2", "c.5471G", ">", "A/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Arg1824His", "De", "novo", "Deleterious", "(", "0.001", ")", "Benign", "(", "0.008", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "VUS", "Yes", "16", "CATCH22", "CMA", "MED13L", "syndrome", "MED13L", "c.5444C", ">", "T/p", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Thr1815Met", "Het", ",", "mat", "Tolerated", "(", "0.17", ")", "Probably", "damaging", "(", "1.000", ")", "Disease", "causing", "(", "0.99", ")", "VUS", "LPV", "Yes", "AA", " ", "amino", "acid", ",", " ", "AD", " ", "autosomal", "dominant", ",", " ", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "CMA", " ", "chromosomal", "microarray", ",", " ", "GHS", " ", "Goldenhar", "syndrome", ",", " ", "hemi", " ", "hemizygote", ",", " ", "het", " ", "heterozygote", ",", " ", "LPV", " ", "likely", "pathogenic", "variant", ",", " ", "mat", " ", "mat...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "VUS", " ", "variant", "of", "uncertain", "significance", "Three", "(", "17.6", "%", ")", "patients", "(", "K1", ",", "K4", ",", "and", "K10", ")", "had", "suspected", "syndromes", ",", "such", "as", "Noonan", "syndrome", ",", "based", "on", "fac...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "GHD", "\n", "The", "patient", "was", "confirmed", "to", "have", "cleidocranial", "dysplasia", "with", "a", "de", "novo", "missense", "mutation", ",", "c.578G", ">", "A", "(", "p.", "R193Q", ")", ",", "in", " ", "RUNX2", "\n", "Patient", "K...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...

[ " ", "in", " ", "RPS6KA3", " ", "was", "identified", "in", "a", "patient", "with", "Coffin-Lowry", "syndrome", "\n", "Patient", "K10", "displayed", "severe", "SS", "(", "-", " ", "4.27", "SDS", ")", "\n", "He", "showed", "dysmorphic", "facial", "features",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "autosomal", "dominant", "type", "51", "\n", "Patient", "K2", "was", "initially", "suspected", "of", "having", "Turner", "syndrome", "with", "a", "severe", "SS", "(", "-", " ", "3.06", "SDS", ")", ",", "dysmorphic", "facial", "features", ",", "such", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "she", "was", "diagnosed", "with", "HCS", "caused", "by", "a", "de", "novo", "missense", "variant", ",", "c.2816C", ">", "T", "(", "p.", "P939L", ")", "in", "the", " ", "NOTCH2", " ", "gene", "(", "Fig.", " ", "2", "g", ")", "\n", "Fig", "\...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...

[ " ", "c", " ", "hypertelorism", ",", "epicanthal", "fold", ",", "broad", "nose", ",", "anteverted", "nares", ",", "short", "philtrum", ",", "large", "mouth", ",", "thick/everted", "lips", ",", "and", "large", "ears", ",", "in", "patient", "K4", "with", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "f", " ", "relative", "macrocephaly", "with", "frontal", "bossing", ",", "short", "arms", "and", "legs", ",", "and", "brachydactyly", "in", "patient", "K9", "with", "acromesomelic", "dysplasia", "Maroteaux-type", ";", " ", "g", " ", "small", "chin", ",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "j", " ", "hypotonic", "fish-mouth", "appearance", ",", "hypertelorism", ",", "and", "flat", "nasal", "bridge", "with", "bulbous", "nasal", "tip", "in", "patient", "K16", "with", "MED13L", "syndrome", ";", " ", "k", ",", " ", "l", " ", "her", "(", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "d", " ", "wormian", "bones", "are", "marked", "by", "yellow", "arrows", "in", "the", "lambdoidal", "suture", ";", " ", "e", " ", "lumbar", "scoliosis", "is", "marked", "by", "yellow", "arrows", ";" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "f", " ", "malocclusion", "and", "biconcave", "vertebra", "bodies", "marked", "by", "yellow", "arrows", "\n", "Two", "novel", "heterozygous", "variants", "in", "the", " ", "NOTCH2", " ", "gene", "(", "NM_024408.3", ")", "\n ", "g", ",", " ", "h", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", ...

[ " ", "shown", "in", "the", "dark", "square", "box", "\n", "Sequences", "were", "aligned", "using", "blastp", "[", "https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/", "]", ";" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "i", ",", " ", "j", " ", "wild-type", "and", "mutant", "residues", "(", "p.", "P939L", "and", "p.", "R1824H", ")", "in", "the", "NOTCH2", "protein", "are", "shown", "in", "light-green", "and", "are", "also", "represented", "as", "sticks", "alongsid...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "indicating", "any", "type", "of", "interaction", "\n", "Purple", "dots", "represent", "metal", "complex", "interactions", "with", "a", "surrounding", "residue", "\n", "Orange", "dots", "represent", "weak", "hydrogen", "bonds", "with", "a", "surrounding", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "manifestations", ",", "such", "as", "asymmetric", "face", ",", "right", "cryptotia", ",", "nasolabial", "fold", ",", "and", "small", "mouth", "with", "a", "high", "arched", "roof", "of", "the", "mouth", "(", "Fig.", " ", "1", "d", ")", "\n", "He", "d...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "in", " ", "TNNT3", " ", "was", "identified", "in", "the", "proband", "and", "his", "family", "members", "and", "was", "responsible", "for", "Sheldon", "Hall", "syndrome", "(", "SHS", ")", "\n", "Two", "(", "11.7", "%", ")", "patients", "(", "K8",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "in", " ", "ARID1B", " ", "and", "patient", "K12", "harbored", "a", "de", "novo", "novel", "variant", ",", "c.1453_1455delGCT", "(", "p.", "A485del", ")", ",", "in", " ", "SMC3", ",", "which", "is", "related", "to", "a", "mild", "variant", "of", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "however", ",", "no", "mutation", "was", "found", "in", " ", "FGFR3", "\n", "Dysmorphic", "facial", "features", ",", "such", "as", "relatively", "macrocephaly", "with", "frontal", "bossing", "and", "micrognathia", ",", "were", "observed", "(", "Fig.", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "(", "p.", "A776W", ")", ",", "in", "the", "kinase", "homology", "domain", "of", "the", " ", "NPR2", " ", "gene", "was", "identified", "in", "the", "proband", "and", "her", "father", "(", "Fig.", " ", "3", "c", ")", "\n", "Fig", "\n", "3", ...

[ "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...